第285章 论文里掺了药（感谢NoSmoking的盟主！）

第285章 论文里掺了药（感谢NoSmoking的盟主！）

　　江河一笑，道：“别激动，慢慢说。”

　　冯野开始叽里咕噜。

　　“老大！我这段时间不是把国际上主流的分子动力学模拟软件，像AMBER和GROMACS全部研究了一遍嘛？我！发！现！他们的分布式计算架构有一个巨大缺陷，就是节点间的通信延迟太高，所以我重新写了一套MPI调度逻辑，引入了马尔可夫状态模型（MSM）的概念，把蛋白质构象的连续变化轨迹切分了，就是说啊，咱们以后不需要让超算搞一条长轨迹，搞到昏头，慢嘟要死，是并行，并行概念！就是跑短轨迹，然后拼接起来……”

　　冯野越说越兴奋，专业词汇不断往外蹦。

　　江河其实是听不懂的。

　　但他微笑地听着，时不时嗯嗯两声，以作回应。

　　对于项目组成员激动汇报成果的时刻，他从来不缺乏耐心。

　　温柔的勒~

　　几分钟过后。

　　冯野终于说完了，道：“老大，大概就是这样！！！”

　　江河先夸：“真棒！”

　　简单的儿童心理学。

　　令冯野隔着电话都笑得合不拢嘴。

　　然后江河道：“来吧，用我听得懂的方式再说一遍。”

　　“哦哦哦！抱歉老大！”

　　冯野挠了挠头，道：“老大，简单来说，就是我把筛选和模拟的时长，缩短了至少……嗯，百分之九十？”

　　这其实说的都保守了。

　　单流程和并行流程比起来，效率根本不可同日而语。

　　针对不可成药靶点的高通量虚拟筛选，时间就是金钱。

　　缩短百分之九十，太牛逼了。

　　冯野是个天才。

　　但很快，他又说道：

　　“但是老大，哪怕缩短了这么多……KRAS蛋白表面的面积依然很大，我们要在整个蛋白表面寻找，呃，可能不存在的口袋，并且用几百万种小分子化合物去做分子对接模拟，这依然很耗时，咱要用超算一直跑，哪怕是租用【魔方】，可能也需要大半年的时间，才或许能找到一个有效的靶点？当然了，前提是真的有这个靶点存在……”

　　江河问：“如果我给你一个范围呢？”

　　“范围？”

　　“嗯，如果我在KRAS蛋白上给你圈定一个氨基酸坐标范围，是不是能够进一步缩短工作时间？”

　　“那绝对可以啊！如果有范围的话，肯定会好很多！”

　　“行，我今晚回去查一下文献，看看我对哪一块儿比较在意，咱们就先跑那个范围。”

　　“明白！我这边等您的数据！”

　　挂断电话。

　　江河回到酒店。

　　今天心情是真呀嘛真不错。

　　实际上。

　　江河不仅知道范围……

　　他其实连KRAS G12C突变体上隐蔽的“Switch-II”口袋的具体坐标，以及能与半胱氨酸共价结合的化合物大体结构都清楚。

　　前世已经被研究出来的东西了呀。

　　不直说，只是避免被抓去做切片研究而已……

　　冯野那边有这么大进展，自己这边也得加速了。